Ang kwento ni Kanon, na itinakda sa kalagitnaan ng taglamig, tungkol sa isang pangkat ng limang batang babae na nakakonekta pabalik sa parehong lalaki. Si Yuichi Aizawa, ang pangunahing tauhan, ay bumisita sa lungsod kung saan naganap ang kwento pitong taon bago magsimula ang kwento.
Sa simula Yuichi ay napaka hiwalay mula sa lungsod at mga naninirahan dito. Bago siya bumalik, napagpasyahan na siya ay manatili sa kanyang pinsan na si Nayuki Minase, at ina nito na si Akiko. Matapos ang kanyang mahabang pagliban, nakalimutan ni Yuichi ang halos lahat maliban sa mga maliliit na detalye ng nangyari pitong taon bago at kailangan na mapaalalahanan ang naiwan niya.
Sa araw pagkatapos ng pagbabalik ni Yuichi, kasama niya si Nayuki na nagpapakita sa kanya sa paligid ng bayan. Naaalala ni Nayuki na kailangan niyang bumili ng mga bagay para sa hapunan at nag-aatubili na sumama sa kanya si Yuichi, na nagtatalo na baka mawala siya. Ilang sandali matapos siyang iwan ni Nayuki na naghihintay sa sidewalk, isang kakaibang batang babae na nagngangalang Ayu Tsukimiya ang umakbay sa kanya na may kaunting babala. Nang makabawi, hinatak niya siya palayo sa isang kalapit na cafe at ipinagtapat na hindi sinasadyang nakawin ang isang bag na puno ng taiyaki matapos na aksidenteng takot ng tindero bago siya nagkaroon ng pagkakataong magbayad. Pagkatapos ay hinatak ni Yuichi si Ayu pabalik sa salesman, pareho silang humihingi ng paumanhin para sa gulo, at pinatawad si Ayu. Napagpasyahan nilang magtagpo muli sa ibang araw at umalis si Ayu.
Si Yuichi ay walang kamalayan sa una, ngunit ang tatlong iba pang mga batang babae na nakalimutan niya ay pamilyar sa kanya. Sa buong kwento, habang nalalaman niya ang tungkol sa hindi pangkaraniwang mga pangunahing katangian ng bayan, naalala ni Yuichi ang bawat batang babae at ang mga kaganapan ng pitong taon na ang nakalilipas sa lungsod na natatakpan ng niyebe.
